То обстоятельство, что открытые системы связаны с другими открытыми системами потоками, создаёт проблему анализа их целостных свойств, поскольку выделение системы для проведения анализа означает разрушение потоков и разрушение целостности системы. Обычно структура системы познаётся через описание состава и взаимосвязи элементов. Для анализа необходимо разложить систему и выделить элементы. Операция расчленения системы приводит к потере тех свойств системы, которые обусловлены её целостностью, поскольку целое не есть простая сумма свойств его частей. Это ставит под сомнение возможность познания структуры открытой системы в условиях ее поточного обмена со своим окружением. Возникает вопрос: « Каким образом можно описать структуру и качество открытой системы, определить её состояние и устойчивость?»
Анализ открытой системы без потери её целостных свойств не является тривиальной задачей. Дело в том, что любой анализ предполагает разложение сложной системы на более простые элементы. Но такая операция приводит к потере тех свойств исследуемого элемента, которые он имел, когда он принадлежал структуре более сложной системы [7-9].
Изучение открытой системы, как неразрывной части окружающих её иерархически более сложных открытых систем, требует выбора таких её структурных элементов - объектов исследования, которые сохраняли бы при анализе (выделении их из сложной системы) целостные свойства системы в виде общей пространственно-временной структуры [8].
В соответствии с современной методологией системных исследований самоорганизующихся систем, только процесс, как теоретический объект исследования, сохраняет собственные, независимые свойства системы и одновременно целостные свойства системы с социальной и с природной средой [7].