У зародыша человека после 20-го дня (на 3-й неделе) кишечная энтодерма образует первичную кишку, которая начинается и заканчивается слепо. На 4-й неделе внутриутробной жизни первичная кишка располагается впереди хорды.
В конце 4-й недели эмбрионального развития на головном конце зародыша появляется впячивание эктодермы - ротовая ямка, а на хвостовом - заднепроходная ямка. Ямки отделены от плоскости первичной кишки двухслойными перепонками: глоточной, которая прорывается на 4 - 5-й неделе, и заднепроходной, которая прорывается позже в конце 5-й недели развития. В результате этого первичная кишка с двух сторон получает сообщение с внешней средой. У первичной кишки выделяют головную и туловищную части. Головная кишка в свою очередь делится на ротовую часть и глоточную кишку, туловищная - на переднюю, среднюю и заднюю кишки. Из ротовой части, выстланной эпителием эктодермального происхождения, образуется часть ротовой полости, из глоточной кишки, выстланной энтодермальным эпителием, формируются глубокие отделы полости рта и глотка. Из передней кишки формируются пищевод, желудок и начальная часть двенадцатиперстной кишки, из средней - тонкая, слепая, восходящая и поперечная ободочные кишки, печень и поджелудочная железа, из задней кишки - нисходящая и сигмовидная ободочные, прямая кишки. Из сомато- и спланхно-плевры образуется брюшина. На внутренних боковых стенках глоточной кишки появляются пять первых жаберных карманов, между которыми располагаются висцеральные (жаберные) дуги: первая - челюстная, вторая - подъязычная висцеральная дуги, третья, четвертая и пятая - собственно жаберные дуги. Из челюстной дуги вместе с прилежащими тканями образуются парные верхнечелюстные и нижнечелюстные отростки, которые ограничивают ротовую бухту снизу и с боков, ее верхняя граница - лобный отросток, который отходит от формирующегося основания черепа. На 5 - 6-й неделе на лобном отростке появляются обонятельные ямки, будущие ноздри. В дальнейшем лобный отросток делится на срединный и боковые носовые отростки, из которых формируются наружный нос, перегородка носа и стенки носовой полости. В то же время верхнечелюстные отростки сближаются, срастаются с боковыми носовыми отростками, образуя верхнюю губу. На внутренней поверхности верхнечелюстных отростков возникают валики, которые растут навстречу друг другу, образуя небо. Из верхнечелюстных отростков формируются верхние челюсти, из нижнечелюстных - нижняя губа, нижняя челюсть и дно полости рта. Эктодерма, покрывающая края верхнее- и нижнечелюстных отростков, дает начало зубам.
Из эпителия I жаберного кармана образуется эпителий слизистой оболочки барабанной полости и слуховой трубы, из II - эпителий миндаликовой ямки, из III - IV - тимус и паращитовидные железы. Щитовидная железа формируется из эпителия передней стенки глотки на границе между I и II дугами. Из висцеральных дуг формируются: из I - молоточек и наковальня, вокруг хрящевой части из мезенхимы - верхняя и нижняя челюсти; из II - малые рога подъязычной кости, стремя и шиловидный отросток; из III (жаберной) - большие рога подъязычной кости. Из закладок на вентральной стенке глотки в области I - II жаберных дуг возникает язык. Из выроста эпителия вентральной стенки кишки на границе между ее глоточной и туловищной частями формируются органы дыхания. Уже в конце первого месяца развития можно различить первичную полость рта, глотку, пищевод, желудок и кишку. На втором месяце часть кишечной трубки интенсивно растет, образуя веретенообразное расширение - будущий желудок, который в дальнейшем изгибается и поворачивается вправо на 90о, и кишечную (пупочную) петлю, в которой различают нисходящее и восходящее колена, а от вершины отходит желчно-кишечный проток, соединяющий кишку с желчным мешком. Из нисходящего колена образуется тонкая кишка, из восходящего - конечный отдел тонкой кишки, слепая, восходящая и поперечная ободочные кишки. Энтодерма стенки двенадцатиперстной кишки образует краниальное и каудальное выпячивания, из которых развиваются печень и желчный пузырь. Из ее вентрального и дорсального выпячивания в этой же области формируется поджелудочная железа. Развивающиеся печень и поджелудочная железа сохраняют связь с кишкой в дальнейшем при помощи будущего общего желчного протока и протока поджелудочной железы. На протяжении 2 - 3-го месяца развития задняя кишка, находившаяся в срединной плоскости, смещается влево и вверх, а кишечная петля поворачивается на 180О, в результате этого зачаток слепой кишки оказывается вверху справа (восходящее колено), а нисходящее колено кишечной петли обращено вниз. Во второй половине внутриутробного развития слепая кишка опускается в правую подвздошную ямку, кишечная петля поворачивается по часовой стрелке еще на 90о (всего поворот на 270о). Нисходящее колено кишки значительно удлиняется, в результате этого кишка многократно изгибается, образуя петли, последние смещают кверху развивающуюся поперечную ободочную кишку. Восходящая ободочная кишка располагается справа, прилегая к задней стенке брюшной полости, а поперечная ободочная ложится поперек. Это ведет к образованию правого изгиба ободочной кишки. Одновременно верхний отдел задней кишки перемещается влево, прирастает к задней стенке брюшной полости, образуя нисходящую ободочную кишку. Между ней и поперечной ободочной кишкой формируется левый изгиб ободочной кишки.